Konservasi atau penanganan benda cagar budaya bawah air sangat berbeda dengan pananganan dan konservasi benda cagar budaya yang ada di darat. Hal tersebut dikarenakan kondisi lingkungan yang berbeda. Selain itu bcb yang ada di laut juga akan lain penanganannya dengan bcb yang ada di sungai maupun rawa.

Dalam melakukan penanganan bcb bawah air khususnya dalam melakukan pengangkatan bcb dari dasar laut harus dilakukan secara cermat dan hati-hati serta adanya persiapan yang matang agar tindakan yang dilakukan tidak membahayakan bcb itu sendiri.

Yang harus diperhatikan disini adalah kondisi antara dasar lautv tempat bcb ditemukan dengan permukaan pasti berbeda. permasalahan yang dihadapi adalah tekanan udara, perbedaan tekanan udara dapat menyebabkan bcb jadi rusak.

tahap selanjutnya adalah pengurangan kadar garam. karena bcb bawah air berada di dasar laut dalam jangka waktu yang lama tentu akan mengandung kadar garam yang tinggi. pengurangan kadar garam dilakukan secara bertahap dan memerlukan prosos waktu yang lama sampai kondisi bcb tersebut mendekati stabil.

Tahap berikutnya adalah menghilangkan kerak-kerak maupun karang yang menenpel pada permukaan bcb. tahap ini juga memerlukan penanganan yang cermat karena apabila tidak hati2 justru akan menghilangkan patina dari benda tersebut.